Cell Res：北京基因组所合作探究 RNA 甲基化调控 R -loop 形成及转录终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合多肽和单多肽 DNA 组成的特殊性碱基在结构上，在原核和内共生生物的测序里面分布较广且长期存在。R-loop 在很多关键的生物科学过程里面体现重要功用，之外细胞核粘贴、核苷酸抑制、DNA 损伤修复以及测序反应性等，但其如何被精确抑制的选择性尚能不相符。m6A 粘贴作为不久前 RNA 上丰度最高的粘贴类型，较广参与爬行动物的发育不良、致病、干细胞更新、糖类分化、以及填充和转回等生命过程。然而，迄今为止尚能不相符 m6A 是否能作为 R -loop 里面 RNA 组分的总括特征来抑制 R -loop 准确度，进而体现各种生物科学功用。里面科院北京测序数据分析所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前题名工作团队合作数据分析，推测 m6A 能平稳 R-loop 的转变成，进而抑制蛋白质核苷酸的有效重新启动。这一成果以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》为题于 10 月 12 日在线发表于《细胞数据分析》（Cell Research）杂志。数据分析工作团队首先通过斑块分子混种和致病荧光技术开发，推测敲低 m6A 大板基转回酶 METTL3 纯着降低 R -loop 准确度，且该抑制抑制作用举例来说 METTL3 大板基转回酶活性。随后，工作团队成员来进行高效液相色谱合组气相技术开发，推测相较于染色体结合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 组分有更加富集的 m6A 粘贴。必要性来进行基于单多肽 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合多肽致病共约沉淀核酸测序技术开发（ssDRIP-seq），推测降至的 R -loop 主要富集在核苷酸重新启动区域，R-loop 变化程度与 m6A 的距离和粘贴准确度相关。为了冒险 m6A 对 R -loop 抑制的生物科学功用，数据分析工作团队绘制了 RNA 磷酸化核苷酸核糖体的高分辨率图谱，并在 MYC、ACTIN 蛋白质上进行多种核苷酸活性检测，推测 m6A 促进 R -loop 转变成是核苷酸重新启动阶段的关键步骤，可以防止 RNA 磷酸化的核苷酸通读。最后，工作团队成员构建了针对核苷酸通读的报告蛋白质系统，通过 m6A 粘贴核糖体的基因必要性证明 m6A 对于 R -loop 转变成及核苷酸重新启动的关键抑制作用。该数据分析推测了 m6A 酪氨酸粘贴的共约核苷酸抑制功用，揭示了 RNA 酪氨酸粘贴对细胞核在结构上的影响，以及 R-loop 在结构上里面的 RNA 组分被粘贴后对其自身稳态的抑制选择性，论述了 m6A 通过平稳 R-loop 而促进核苷酸正常人重新启动的现象，为必要性数据分析 m6A 与 R-loop 的抑制选择性和相应生物科学功用缺少了基本上的技术开发和理论支撑。该数据分析得到了里面国科学院关键性同步进行科技产业专项、国家所自然科学以及国家所全面性研发计划等基金拨款。零碎出处：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).